الجامعة هي مؤسسة عمومية دات طايع اداري وهي تخضع لقواعد المحاسبة العمومية ادن فهي خاضعة للرقابة القبلية مجسدة في المراقب المالي ولجنة الصفقات العمومية فمراقبة الاول تقوم على كل الطلبيات والاستشارات والصفقات هده الاخيرة خصها المشرع براقبة اخرى هي رقابة لجنة الصفقات وفي حال مطابقة الاجراءات الصادرة عن الامر بالصرف للقوانين المعمول بها تعطى له تاشيرة الرقابة القبلية.وتوجد رقابة انية تتمثل في الرقابة الداتية داخل المؤسسة ورقابة المحاسب العمومي.اما الثالثة فهي الرقابة البعدية وتتمثل في رقابة مجلس المحاسبة والمفتشيةالعامة للمالية ورقابة الوصاية وغيرها من الهيئات العمومية المخولة قانونا للتدخل في حال شاب شك في طرق صرف المال العام